La iniciativa de aire limpio se centra en contrarrestar el deterioro de la calidad del aire urbano en las ciudades de la región causado por la rápida urbanización, el incremento del transporte vehicular y la producción industrial. Se ha demostrado que la contaminacion del aire es la causa de miles de muertes prematuras y de miles de millones de dólares en costos médicos y de pérdidas en productividad en todo el continente cada año. Este programa fue creado en un Taller de Lanzamiento llevado a cabo en Diciembre de 1998 en Washington, D.C. Se conformó un Comité Directivo constituido por los gobiernos de las ciudades, empresas del sector privado, agencias de desarrollo internacional y fundaciones, organizaciones no gubernamentales (las ONG) e instituciones académicas. El Comité Directivo se reúne dos veces al año para supervisar los resultados y la gestión del programa, a cargo de uns Secretaría Técnica con personal del Banco Mundial.