La geoquímica orgánica del petróleo se utiliza tradicionalmente en la exploración de hidrocarburos para caracterizar y correlacionar petróleos y rocas madres. En las últimas décadas las técnicas geoquímicas se han aplicado exitosamente en la caracterización de reservorios. Una importante aplicación es la alocación de la producción conjunta de reservorios multicapa. El objeto de este trabajo es presentar la metodología geoquímica desarrollada para alocar la producción y su aplicación en algunos yacimientos de las cuencas Neuquina y del Golfo San Jorge ubicados en Argentina. En los mismos se discuten las condiciones de aplicación, el tipo de muestras requeridos, los parámetros geoquímicos que pueden utilizarse y las metodologías analíticas más adecuadas. Se discuten además, las ventajas que aporta esta metodología y se comparan sus resultados con la metodología de discriminación de la producción habitual.