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La competitividad de la fermentación anaeróbica de residuos orgánicos para producir combustibles gaseosos de bajo impacto ambiental ha sido extensamente tratada en la literatura. No obstante el gran número de bio-reactores en servicio –la mayoría de ellos en módulos familiares en países asiáticos- no existen registros de procedimientos de diseño fundados en la optimización de la concentración de sustrato o dinámica de fermentación utilizados. El artículo propone un algoritmo de cálculo de concentración óptima basado en una seudolinealización de la reacción. En adición a la inhibición por concentración de sustrato, el algoritmo incorpora el decaimiento de crecimiento bacteriano por variaciones de temperatura y acidez de la solución. Se exhiben salidas del programa digital implementado para una aplicación paramétrica con datos básicos del bio-reactor piloto de la UTN Confluencia combinados con un rango de constantes de crecimiento e inhibición.